소화성 십이지장 궤양을 이해하기 위해서 위의 생리학에 대해서 알아야할 필요가 있다. 여기에서는 위의 혈액 공급, 위 점액의 생산, 위산 분비 촉진 호르몬, 염산의 분비 그리고 펩신 등에 초점이 맞추어질 것이다.

 위는 식도, 위 그리고 위의 빈 공간에 위치에 있는 분문 호르몬 샘(cardiac gland)(식도와 위 사이에) 그리고 유분 호르몬 샘(pylotic gland)(위와 십이지장 사이에)에서 위의 점액이 생산이 된다. 위의 빈 공간의 유분 호르몬 샘에서 위산 분비 촉진 호르몬이 분비된다. 정수리 세포(위벽 세포) 덩어리(the parietal cells)에서는 염산이 생산이 된다. 그리고 으뜸 세포(the chief cells)에서는 펩시노겐이 생산이 된다. 위는 은 또는 다른 금속에 잘 염색이 되는 아르젠타피네(argentaffine) 세포들을 포함하고 있다. 염산은 수면 동안에도 계속해서 방출이 되어지고 있다.

 소화성 십이지장 궤양은 위산 과다가 특징이다. 이것은 위에서 산성을 분비를 컨트롤하는 정상적인 규제 과정들의 실패일 수 있다.

 위산 분비를 컨트롤하는 정상적인 규제 과정은 다음과 같다. 위산 분비의 억제는 항상 여러 개의 규제 기재들 즉 자아-규제와 외부적인 규제로 이루어져 있다.

 기초 분비를 넘어선 위산 분비의 눈에 띄는 증가는 음식을 눈에 보거나, 음식 냄새, 음식의 맛 그리고 음식에 대한 생각들에 의해서 위산 촉진 호르몬의 방출로서 위산과 펩신의 분비가 증가 되어진다. 이러한 증가는 미주 신경과 위산 분비 촉진 호르몬에 의해서 조정이 된다(Brooks, 1973). 음식이 유입이 되면 위에서 pH 농도가 묽어지고 위산은 침, 위의 점액에 의해서 중화가 되어지고, 역류되어지는 알카리성의 십이지장의 내용물에 의해서 중화가 되어진다. 십이지장의 내용물이 한층 더 산성화 되어질 때 소장에서 분비하는 호르몬인 세크라틴(secretin)이 분비 되어져서 췌장의 중탄산염(중조), 소금과 물의 분비를 자극한다. 이것이 위산 촉진 호르몬에 의해서 자극 되어진 위의 염산 분비를 억제한다. 췌장에서 분비되는 호르몬인 글루카론과 중탄산염(중조)은 염산의 분비를 억제한다(Hubel, 1972, Johnson & Grossman, 1968).

 미주 신경(vagus nerve)은 위산, 펩신 그리고 위산 분비 촉진 호르몬의 방출을 규제한다. 미주 신경의 절단은 위산, 펩신, 위산 분비 촉진 호르몬의 방출이 사라졌다. 반대로 미주 신경의 자극은 위산 분비의 증가(Shaw & Urghart, 1972)와 개들 한데서 실험적인 위 궤양과 십이지장 궤양을 생산을 했다(Jefferson, 1963).

 소화성 십이지장 궤양을 가진 사람들은 정상인 보다 더 큰 위와 정수리 세포 덩어리가 커져 있었다(Cox, 1953). 인간의 유아의 위는 어른들에 있어서 눈에 띄는 다양한 크기를 보여주지 않았다. 고로 위가 커진 것은 미주 신경 방출의 증가에 의해서 위의 지속적이고 과도한 자극으로부터 결과한 것으로 본다(State, 1971).

 루마치스 관절염 환자들이 소화성 십이지장 궤양을 많이 가지고 있었다. 이것은 루마치스 관절염 환자들이 복용하는 약물들인 인도메타신, 페닐부타존 등에 들어있는 살리실산염(관절염 통중 치료제인 진통, 해열, 소염제) 때문으로 드러났다(Cooke, 1967). 살리실산염은 위 점막을 갈까먹고 위에 출혈의 원인이 된다.